Se você está utilizando o logotipo no Tamanho Recomendado, não há necessidade de editar a altura do Topo da página.
Caso você está utilizando um logotipo quadrado, ou diferente do tamanho recomendado, você pode editar a altura do topo, para que o seu Logotipo se encaixe bem dentro do Topo do Site.
Você pode editar a altura do Topo do site, acessando o gerenciador de conteúdo, no menu: Criador de Site / Topo e clique no botão Editar.
Existem duas medidas de altura:
Header - Topo da Página (Em pixels)
Header - Quando Rolar a Página pra Baixo (Em pixels)
Ajuste a medida conforme desejado e clique em Salvar.
Em seguida acesse o site e veja se ficou bom, se precisar, ajuste novamente até ficar como desejado.